Der Zürcher Fachhochschulrat setzt sich aus dem für das Bildungswesen zuständigen Mitglied des Regierungsrates und sechs bis acht vom Regierungsrat mit Genehmigung des Kantonsrates gewählten Persönlichkeiten aus Wissenschaft, Kultur, Wirtschaft, Sozialwesen und Politik zusammen. Die Amtsdauer der gewählten Mitglieder beträgt vier Jahre. Wiederwahl ist zweimal möglich.
Der Fachhochschulrat wird von der Bildungsdirektorin geleitet. An den Sitzungen nehmen neben den gewählten Mitgliedern mit beratender Stimme die Rektorin der ZHdK, die Rektoren der PHZH und ZHAW, je eine Vertreterin oder ein Vertreter der Studierenden, der Dozierenden und des übrigen Hochschulpersonals sowie die Chefin des Hochschulamts teil.